Секрет, який відрізняє хачапурі по-мегрельські від інших – це подвійний сир. Сулугуні знаходиться як всередині, так и зовні хачапурі. Ніжний солонуватий сир тане під час випікання і просочує пори тіста, відчого у страви неповторний смак.